Блог Samoedd > Научный Софт > FishResp: графическое приложение и R пакет для анализа обмена веществ водных организмов!
FishResp: графическое приложение и R пакет для анализа обмена веществ водных организмов!

Друзья-биологи, в особенности физиологи, зоологи, ихтиологи и гидробиологи! Если Вы или кто-то из Ваших коллег интересуется респирометрией: т.е. хотите измерить обмен веществ водного организма (неважно, будет это дафния, осьминог или окунь); то у меня для Вас хорошие новости: софт FishResp - готов, научная статья - опубликована, а официальный сайт и Twitter - запущены!
Но главное, эта программа - лишь первый этап проекта "FishResp". В этом году я разрабатываю оборудование для проведения респирометрических экспериментов на общемировом уровне, которое сможет собрать каждый. Подробности в этой статье!
1. Разработка программы FishResp завершена!

Мы наконец-то завершили разработку бесплатного софта "FishResp" для анализа респирометрических данных. Программа написана на языке R и оформлена в R пакет. Однако, если Вы предпочитаете не иметь дело с программированием, то просто скачайте графическое приложение, дизайну которого было уделено особенное внимание.

Особенности программы FishResp:
- бесплатная с открытым исходным кодом
- кроссплатформенная (Windows, Linux, MacOS)
- импортирует данные из любой системы респирометрии
- может одновременно работать с 8 организмами!
- множество алгоритмов расчета обмена веществ (читайте подробности в научной статье)
2. Научная статья про FishResp опубликована!
Три недели назад была опубликована научная статья в журнале Conservation Physiology, посвященная обзору "FishResp": все от технических характеристик до анализа данных на реальных примерах описано в публикации. Для демонстрации возможностей, мы запустили два эксперимента с рыбками гуппи (Poecilia reticulata) и трехиглыми колюшками (Gasterosteus aculeatus) в Stockholm University и University of Helsinki, соответственно.

3. Сайт создан, твиттер запущен, оборудование проектируется!
Цель проекта FishResp - создать не только бесплатную программу для анализа данных, но также и оборудование, которое каждый исследователь сможет собрать своими руками за 500$. (см. рисунок внизу) Сейчас на рынке системы респирометрии стоят от 15.000$, что делает этот метод недоступным для большинства исследователей!!!

Если Вам интересна вышеописанная некоммерческая разработка, то следите за новостями на сайте и в Твиттере. Также я буду показывать первые результаты разработки оборудование на конференции SEB2019. Буду рад Вас встретить там и обсудить. Также всегда рад Вам ответить в комментариях, в ВК или по почте: fishresp[собака]gmail.com
Комментарии: 2
wlxky1
7zgv26